La I. E. Micaela Bastidas nació como anexo del Colegio Juana Cervantes de Bolognesi, bajo la dirección de la Sra. Prof. Gladis Fuster de Pozo con Resolución Suprema N° 660 del 31 de diciembre de 1963.
Comienza a funcionar como Institución Educativa Independiente siendo la primera directora la Sra. Olga Paredes de Núñez, la que inicia su labor el 15 de abril de 1964 con 21 docentes y 701 estudiantes funcionando en el local de Leticia , trasladándose posteriormente a la calle Manuel Muñoz Najar con el apoyo de los Padres Claretianos.